为推动重点实验室自主创新能力的加快积聚和提升，重点实验室按照《山东省重点实验室建设管理办法》及其他山东省科学技术厅政策相关规定要求，制定了一系列的规章管理制度。争取重点实验室建设的多元化投入，将经费重点投入到基础理论研究、前沿科学探索、基础科学人才培养方面，建设创新研究环境，打造学科交叉融合平台。原山东省网络重点实验室具备完备规章制度，且经过十余年运行检验，运行效果良好。为进一步理顺实验室管理体制机制，提升实验室建设管理规范化水平，在原有实验室管理文件体系上新制定了一系列规章制度，主要包括：《山东省泛在智能计算重点实验室章程》、《山东省泛在智能计算重点实验室学术委员会工作条例》《山东省泛在智能计算重点实验室开放课题管理办法》、《山东省泛在智能计算重点实验室人才激励与考核培养制度》、《山东省泛在智能计算重点实验室知识产权保护规定》、《山东省泛在智能计算重点实验室安全管理规定》、《山东省泛在智能计算重点实验室学术交流管理办法》《山东省泛在智能计算重点实验室仪器开放管理办法》等。这些制度在“评价、分配、管理”进行了体制机制改革，建立了重点实验室人、财、物等相对独立的管理机制。

此外，这些制度的制定保障了重点实验室研究人员的人身安全，并形成符合重点实验室自身特点的科技创新运行机制。重点实验室定期召开工作会议，总结交流制度在实践中的经验教训，及时进行补充修订。每年印制详细的工作总结和研究工作进展情况报告，编印反映实验室全面情况的年报；办公室负责科研项目档案管理工作，各种科研计划报告、项目评估报告、成果报告、论文论著以及各种实验室文件资料，及时规范归档，做到档案管理网络化、公开化和透明化，随时提供查阅。